河套學院農學系是1985年建校初期設立的系部之一。現有教職工65人，其中專任教師51人。專任教師中教授4人，副教授25人，高級職稱教師占比57%；博士10人，碩士31人，碩士以上學歷教師占比80%；雙師型教師20人，占比39%。有自治區級教學團隊2個、教學名師1人、教壇新秀1人、青年科技英才2人；巴彥淖爾市中青年科學技術帶頭人2人、“河套英才”2人、中青年科技人才突出貢獻獎4人、青年創新標兵1人、優秀教師2人。

現有全日制在校生713人，其中本科生651人，蒙語授課學生171人。

現開設農學、動物科學、食品質量與安全、農業資源與環境4個本科專業，食品營養與檢測1個專科專業。自治區一流專業2個，河套學院特色專業1個；自治區級精品課1門、立項在線開放課程1門，院級立項在線開放課程4門，優質課程8門、本科示范課程1門。

自治區級實驗教學示范中心1個、重點實驗室1個、工程技術研究中心1個，市級科研平臺1個、博士工作站6個；院級研究中心3個。校外實習基地22個。

升本以來，獲批國家自然科學基金項目3項，國家留學基金委項目2項，自治區級教科研項目30項。發表SCI 5篇，中文核心68篇；獲取國家專利21項；出版教材專著39部；國家成果庫成果3項；培育作物新品種1個。學生獲批國家級創新創業項目2項、自治區級1項；院級大學生科研項目36項；2016-2020屆本科畢業生考研率平均達16%。